Skip to main content

Table 2 The genetic polymorphism information of seven SNPs at Juno gene in six sheep breeds

From: Expression, structure and function analysis of the sperm-oocyte fusion genes Juno and Izumo1 in sheep (Ovis aries)

Allele Breeds Genotype frequency Allele frequency PIC HE NE Chi-square test (P-value)
g.844598A > G   GG GA AA G A     
Small Tail Han sheep 0.31 0.48 0.21 0.55 0.45 0.37 0.50 1.98 0.49
Tan sheep 0.23 0.53 0.24 0.49 0.51 0.37 0.50 2.00 0.57
Sunite sheep 0.24 0.47 0.29 0.47 0.53 0.37 0.50 1.99 0.63
Suffolk sheep 0.08 0.15 0.77 0.15 0.85 0.23 0.26 1.35 0.01
Dorper sheep 0.07 0.45 0.48 0.29 0.71 0.33 0.41 1.71 0.66
Prairie Tibetan sheep 0.33 0.33 0.33 0.50 0.50 0.38 0.50 2.00 0.05
g.847830T > C   CC CT TT C T     
Small Tail Han sheep 0.53 0.39 0.08 0.72 0.28 0.32 0.40 1.67 0.55
Tan sheep 0.55 0.38 0.07 0.74 0.26 0.31 0.38 1.62 0.94
Sunite sheep 0.48 0.34 0.18 0.65 0.35 0.35 0.46 1.84 0.01
Suffolk sheep 0.92 0.08 0.00 0.96 0.04 0.07 0.08 1.08 0.80
Dorper sheep 0.97 0.03 0.00 0.98 0.02 0.03 0.03 1.03 0.93
Prairie Tibetan sheep 0.48 0.27 0.24 0.62 0.38 0.36 0.47 1.89 0.02
g.847927A > C   AA CA CC A G     
Small Tail Han sheep 0.47 0.33 0.20 0.63 0.37 0.36 0.46 1.87 0.00
Tan sheep 0.52 0.29 0.19 0.66 0.34 0.35 0.45 1.80 0.00
Sunite sheep 0.42 0.35 0.23 0.60 0.41 0.37 0.48 1.93 0.01
Suffolk sheep 0.87 0.13 0.00 0.94 0.06 0.11 0.12 1.14 0.67
Dorper sheep 0.97 0.03 0.00 0.98 0.02 0.03 0.03 1.03 0.93
Prairie Tibetan sheep 0.43 0.26 0.31 0.56 0.44 0.37 0.49 1.97 0.00
g.846268A > G   AA GA GG A G     
Small Tail Han sheep 0.17 0.47 0.36 0.41 0.59 0.37 0.48 1.93 0.59
Tan sheep 0.11 0.51 0.38 0.37 0.63 0.36 0.47 1.87 0.37
Sunite sheep 0.21 0.48 0.30 0.45 0.55 0.37 0.50 1.98 0.83
Suffolk sheep 0.77 0.13 0.10 0.83 0.17 0.24 0.28 1.38 0.00
Dorper sheep 0.40 0.50 0.10 0.65 0.35 0.35 0.46 1.83 0.59
Prairie Tibetan sheep 0.28 0.44 0.28 0.50 0.50 0.38 0.50 2.00 0.50
g.847219G > C   GG CG CC G C  
Small Tail Han sheep 0.74 0.22 0.03 0.85 0.15 0.22 0.25 1.33 0.05
Tan sheep 0.01 0.26 0.73 0.14 0.86 0.22 0.25 1.33 0.55
Sunite sheep 0.00 0.11 0.89 0.06 0.94 0.10 0.10 1.12 0.56
Suffolk sheep 0.00 0.03 0.97 0.01 0.99 0.03 0.03 1.03 0.93
Dorper sheep 0.00 0.13 0.87 0.07 0.93 0.12 0.12 1.14 0.70
Prairie Tibetan sheep 0.00 0.11 0.89 0.06 0.94 0.10 0.10 1.12 0.72
g.847810C > G   CC GC GG C G     
Small Tail Han sheep 0.71 0.28 0.01 0.85 0.15 0.22 0.26 1.34 0.08
Tan sheep 0.64 0.30 0.06 0.79 0.21 0.28 0.33 1.50 0.35
Sunite sheep 0.75 0.25 0.00 0.88 0.13 0.19 0.22 1.28 0.15
Suffolk sheep 0.85 0.13 0.03 0.91 0.09 0.15 0.16 1.20 0.18
Dorper sheep 0.53 0.40 0.07 0.73 0.27 0.31 0.39 1.64 0.90
Prairie Tibetan sheep 0.78 0.22 0.00 0.89 0.11 0.18 0.20 1.25 0.45
g.848253C > A   AA CA CC A C  
Small Tail Han sheep 0.01 0.15 0.84 0.09 0.91 0.14 0.16 1.18 0.38
Tan sheep 0.01 0.25 0.74 0.14 0.86 0.21 0.24 1.31 0.63
Sunite sheep 0.00 0.10 0.90 0.05 0.95 0.09 0.10 1.11 0.60
Suffolk sheep 0.00 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00 NA
Dorper sheep 0.00 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 1.00 NA
Prairie Tibetan sheep 0.00 0.11 0.89 0.06 0.94 0.10 0.10 1.12 0.72
  1. P > 0.05 indicates the locus was under Hardy-Weinberg equilibrium. P < 0.05 indicates the locus was not under Hardy-Weinberg equilibrium